Esta unidad está compuesta los tres laboratorios, que en conjunto realizan el control de calidad de productos destinados a los programas de alimentación complementaria, PNAC y PACAM. Realizan servicios de análisis químico, microbiológico y sensorial, materiales de referencia y ensayos de aptitud, muestreos/inspecciones para la industria alimentaria, rotulado nutricional de alimentos, entre otros.
